Cụ thể, theo Kiểm toán Nhà nước (KTNN), phát hiện tình trạng sai 38,7 triệu đồng chi phí khảo sát khi lập dự án đường cơ động phía Bắc đảo Phú Quốc; phải giảm 4,8 tỷ đồng chi phí xây lắp do làm sai khối lượng. Kết luận còn nêu rõ, hướng tuyến trong dự án đường cơ động phía Bắc đảo Phú Quốc được duyệt không đúng theo quy hoạch tại Quyết định số 633/QĐ-TTg ngày 11/5/2010 của Thủ tướng Chính phủ về việc phê duyệt điều chỉnh Quy hoạch chung xây dựng đảo Phú Quốc, tỉnh Kiên Giang đến năm 2030.
Kiểm toán buộc chủ đầu tư phải cắt giảm 849 triệu đồng do phải giảm chi phí tư vấn và chi phí khác do phải xác định lại tỷ lệ định mức và giảm trừ theo giá trị xây lắp giảm.
Tại dự án đường Trung tâm đoạn 2 (vốn đầu tư 183 tỷ đồng) đoàn kiểm toán yêu cầu giảm trừ giá trị xây lắp số tiền trên 7,27 tỷ đồng do làm tính sai dự phòng phí và sai khối lượng thi công, các chi phí về tư vấn và chi phí khác cũng phải giảm tương ứng.
Cơ quan kiểm toán còn cho biết dự án đường trung tâm đoạn 3 phê duyệt sai tổng mức đầu tư và buộc chủ đầu tư phải giảm trừ chi phí xây lắp số tiền 15 tỷ đồng do làm sai khối lượng, sai đơn giá. Chi phí tư vấn và chi phí khác cũng phải giảm theo 2,1 tỷ đồng do phải xác định lại tỷ lệ định mức và giảm trừ theo giá trị xây lắp.
Kiểm toán Dự án đường nhánh số 4, buộc ban quản lý dự án giảm trừ chi phí xây lắp số tiền 7,7 tỷ đồng với lý do tương tự các dự án trên: Sai khối lượng, sai dự phòng phí và giảm trừ các chi phí khác.
Ngoài những vi phạm trên, KTNN còn phát hiện một loạt sai phạm khác trong việc chấp hành chính sách, chế độ quản lý dự án đầu tư xây dựng tại các công trình, dự án giao thông tại huyện đảo này.