Theo đó, khu vực quy hoạch có phía đông bắc và phía đông nam giáp các khu vực hành lang bảo vệ rạch Thị Nghè rộng khoảng 20m và đường Nguyễn Hữu Cảnh, đoạn từ đường Nguyễn Bỉnh Khiêm đến cầu Thị Nghè 2. Còn phía tây nam và phía tây bắc giáp đường Nguyễn Bỉnh Khiêm, lộ giới 20m và đường Nguyễn Thị Minh Khai, lộ giới 35 m.
Thảo Cầm viên là công viên bách thảo đa chức năng với diện tích dự kiến quy hoạch 16,770 ha. Tại đây có các khu chức năng chính như hệ thống thảm cỏ, cây xanh, mặt nước: 12,032 ha; khu hành chính, văn phòng: 0,07 ha; khu vực chuồng trại nuôi thú: 1,536 ha; khu phụ trợ, nhà vệ sinh, trạm nghỉ chân, biển hướng dẫn: 0,11 ha; khu vực kinh doanh và dịch vụ: 0,56 ha; hệ thống giao thông: 2,182 ha.
Đồng thời, UBND TP. HCM cũng chấp thuận chủ trương xây dựng bãi đậu xe ngầm tại Thảo Cầm viên trên trục đường Nguyễn Thị Minh Khai - Nguyễn Bỉnh Khiêm với quy mô khoảng 3.000 xe máy và 100 ô tô.
Theo đồ án, bãi đậu xe ngầm Thảo Cầm viên có quy mô 1 ha, lối tiếp cận tại trục đường Nguyễn Thị Minh Khai phía dưới các khu vực nhà hàng, khu vui chơi thiếu nhi, chuồng chim cánh cụt và chuồng thú châu Phi.
UBND TP.HCM yêu cầu xây dựng phần hầm ngầm phía dưới các khu chuồng thú phải có giải pháp thi công đồng bộ, chống tiếng ồn để tránh ảnh hưởng đến các loại thú phía trên.
Ngoài ra, Thảo Cầm viên cũng được xây dựng thêm bãi đậu xe máy hai tầng ở phía đường Nguyễn Thị Minh Khai tại khu vực cổng phụ Nguyễn Bỉnh Khiêm và bãi xe mặt đất trên trục đường Nguyễn Bỉnh Khiêm dành cho xe buýt, xe khách của các đoàn đến tham quan, ô tô của khách tham quan, xe của nhân viên Thảo Cầm viên.